【バーチャートレース】新型コロナウィルス感染症(COVID-19)都道府県別推移を作成する【BarChartRace】

このような動画をYoutubeやTwitterで見かけたことはありませんか？

バーチャートレースと呼ばれ、Youtubeでランキング系の動画で利用されている方法です。今回はPythonでデータを整形し、Flourishというサイトで作成する方法を解説します。

データはこちらのcsvを使います。

都道府県別新型コロナウイルス感染者数マップ

日本国内の新型コロナウイルス感染者を、ほぼリアルタイムに地図上にプロットして可視化する高機能ダッシュボードです。

データを整形する
1. ピボットテーブルで整形する
2. 日付別に累積和を算出する
Flourishで作成する
成果物

データを整形する

import pandas as pd
import numpy as np

covid = pd.read_csv("COVID-19.csv")
#感染場所が不明のレコードは集計しない
covid = covid.dropna(subset=['受診都道府県コード'])
covid['受診都道府県コード'] = covid['受診都道府県コード'].astype(np.int)

#MultiIndexで返却されるので整形する
pivot_covid = covid.pivot_table(values=['人数'], index=['受診都道府県'], columns=['確定日'], aggfunc='sum', fill_value=0).transpose().reset_index(level=0, drop=False).transpose()
pivot_covid.reset_index(inplace=True)
pivot_covid = pivot_covid.drop(index=0)
pivot_covid.columns.name = None
pivot_covid = pivot_covid.set_index('受診都道府県', drop=True)
pivot_covid = pivot_covid.cumsum(axis=1)

pivot_covid.to_csv("covid-19_bar_chart.csv")